2014年12月31日水曜日

アクセス

〒252-0374
神奈川県相模原市南区北里1-15-1
北里大学 医学部 解剖学研究室
TEL&FAX: 042-778-9022







メンバー

更新日:2015/04/01

グループリーダー/ Group Leader


太田博樹 / Hiroki Oota
専門分野:遺伝学、分子進化学、ゲノム人類学
Specialized fields: Genetics, Molecular Evolution, Genome Anthropology.






ポスドク研究員 / Postdoctoral Researcher


勝村啓史 / Takafumi Katsumura
専門分野:メダカ人類学、実験集団遺伝学、比較集団遺伝(ゲノム)学
Specialized fields: Medaka Anthropology (Anthropology using medaka fish), Experimental Population Genetics, Comparative Population Genetics (Genomics)
[website]


覚張隆史 / Takashi Gakuhari
専門分野:生物考古学、同位体生態学、ウマ学
Specialized fields: Bioarchaeology, Isotope Ecology, Equine Science.






ライアン・シュミッド / Ryan Schmidt
専門分野:自然人類学、古代DNA、集団遺伝学、骨生物学、形態測定学
Specialized fields: Biological Anthropology, Ancient DNA, Population Genomics, Skeletal Biology and Geometric Morphometrics.
[website] [CV]





大学院生 / Graduate Student


小金渕 佳江 / Kae Koganebuchi (D3/日本学術振興会特別研究員DC2)
専門分野:遺伝人類学、集団ゲノム学、古代ゲノム学
Specialized fields: Genetic Anthropology, Population Genetics, Paleogenomics.
[website]





卒研生 / Undergraduate Student

佐藤克(理学部生物科学科4年)


OB/OG

博士研究員
松前ひろみ(元・統計数理研究所 数理・推論研究系 博士研究員→ 現・Institute of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich 博士研究員)
中込滋樹(現・シカゴ大学 人類遺伝学部 Di Rienzo研究室 博士研究員)

学部生
山下佳那(就職)
井上真佑(就職)
関口陽介(就職)
橋爪陽介(就職)
秋山辰穂(現・総合研究大学院大学博士課程)




研究環境(フィールドワーク)

私たちの研究グループでは研究試料を採取しにフィールドへ行き、それを実験室に持ち帰って様々な実験や解析を行っています。

モデル生物(メダカ)


川に入ってメダカを追い込んでサンプリングします(通称:ガサガサする)

ガサガサ中です



古代ゲノム


共同研究者に骨サンプルを分与していただきに行きます。





研究環境(古代ゲノム)

DNAのコンタミネーションを防ぐため、厳重に管理されたクリーンルームにて、できるだけ皮膚や衣服が露出しない服装で実験を行います。実験風景の一部をご紹介します。

 クリーンベンチでの作業

遠心機での作業

実験で使用する骨を切断中

切断した骨を計量します




業績リスト(その他講演・受賞歴)

企業や外部研究機関での公開セミナー・教育講演等

2002年以前は全て省略。年代の古い順)

1)太田博樹
Title: アルデヒド分解酵素(ALDH2)遺伝子座位の連鎖不平衡解析
東海大学医学部 猪子英俊研究室セミナー(神奈川)20031218

2)太田博樹
Title: ヒトおよびヒト以外の霊長類におけるアルコール分解酵素クラスI遺伝子クラスターの進化
総合研究大学院大学 生命共生体進化学専攻セミナー(葉山)20031230

3)太田博樹
Title: Large Scale Analyses on Alcohol Metabolism Related Genes: Diversity in Human Populations and Evolution in Primates
早稲田大学 理工学部 山元大輔研究室セミナー(東伏見)200489

4)太田博樹
Title: Alcohol Metabolism Related Genes: Diversity in Human Populations and Evolution in Primates
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター(JBIRC)セミナー(東京)2004810日(口頭)

5)太田博樹
Title: Gene Duplication and Conversion: Evolution of the Alcohol Dehydrogenase Gene (ADH) Cluster in Primates
東海大学医学部 猪子英俊研究室セミナー(神奈川)2004126

6)太田博樹
Title: Genomic studies on the alcohol metabolism and the diversity in human and non-human primates
京都大学 自然人類学・人類進化論研究室合同セミナー(京都)20041214

7)太田博樹
Title: A comparative study on the alcohol dehydrogenase (ADH) Class I gene cluster in primates: Duplicated genes “escaped” from homogenization via gene conversion (?)
慶応医学会例会 清水信義研究室主催セミナー(東京)20041216

8)太田博樹
Title: Evolution of the alcohol dehydrogenase (ADH) Class I gene cluster: Duplicated genes “escaped” from homogenization via gene conversion in primate lineage (?)
理化学研究所GSCセミナー(横浜)20041220

9)太田博樹
Title: ヒトおよびヒト以外の霊長類におけるアルコール代謝に関与する遺伝子群の進化と多様性
東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻 人類学談話会(東京)2005614

10)太田博樹
Title: 自然人類学的視点ゲノム医学・創薬に生かすには?
第一製薬株式会社 研究開発本部 創薬研究室主催セミナー(東京)2007125

11)太田博樹
Title: 琉球諸島ヒト集団の歯冠形態と遺伝的多様性の不整合について
国立遺伝学研究所研究会『中立論の現在』(三島)2008728

12)太田博樹
Title: 人類進化とゲノム医学
佐賀大学医学部 分子生命科学セミナー(佐賀)200898

13)太田博樹
Title: 古代DNA分析人類学での発展から考古学への応用へ
明治大学文学部セミナー(東京)2011120

14)太田博樹
Title: 人類の進化と疾患の関係
市民大学 北里大学コース(相模原)2012912

15)太田博樹
Title: 遺伝子が明かす、愛の起源
LOVE展:アートにみる愛のたち」関連プログラム アカデミーヒルズ(六本木ヒルズ森タワー49階)2013429

16)太田博樹
Title: 幸運者生存という視点〜ゲノム人類学の立場から
「資本主義の教養学」公開講演会シリーズ 主催:公益財団法人・生存科学研究所 (東京大学本郷キャンパス 山上会館201-202会議室)2014725


  
アウトリーチ活動

(年代の古い順)

1)2007112325日、2008112224日 サイエンスアゴラ(東京・日本未来館)にブースを出展

2)200781-2日 SPPScience Partnership Program)で千葉県の高校生を2日間受け入れALDH2酵素遺伝子のPCR増幅および塩基配列決定実験を実施

3)200881日 岡山県・金光高校の生徒を受け入れ研究室見学を実施

4)2010918-26日 沖縄県立博物館で開催された一般向け展示会「沖縄科学の最前線 2010」にポスター「沖縄本島・先島諸島の人々の遺伝子」を発表



受賞歴

19958月 第3回国際分子生物進化学会にて Walter M. Fitch Prize 受賞


業績リスト(学会発表・国内外)

招待講演ではない国際学会での発表

2005年以前は太田が発表者の場合のみ、共著での発表は省略。年代の古い順)

1) H. Oota, N. Saitou, T. Matsushita, S. Ueda
Title: A genetic study of 2,000-year-old human remains of Japan (Yayoi period) using mitochondrial DNA sequences. (Talk)
Conference of Biodemography and Human Evolution Symposium; Paleodata for Different Geographical Areas (Apr.20.1995 Florence, Italy)

2) H. Oota, N. Saitou, T. Matsushita, S. Ueda
Title: Phylogenetic study of 2,000-year-old human remains of Japan (Yayoi period) using mitochondrial DNA sequences. (Talk)
The Third International Meeting of Society for Molecular Biology and Evolution (Aug.22.1995 Hayama, Kanagawa, Japan)

3) H. Oota, K. Kuroshaki, S. Pookarjorn, S. Ueda
Title: Analysis of ancient human DNA from Southeast Asia. (Poster)
Second Asia-Pacific Conference on Medical Genetics (Sep.23.1995 Jakarta, Indonesia)

4) H. Oota, N. Saitou, T. Matsushita, S. Ueda
Title: DNA analysis of an ancient human population in the period of Han dynasty, China. (Talk)
The Fifth Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (Jun.2.1997 Munich, Germany)

5) H. Oota, N. Saitou, T. Matsushita, S. Ueda
Title: DNA analysis of 2,000-year-old human remains in Shandong province, China. (Talk)
Conference of Human Genetics: diversity and disease (Jul.22.1997 Perth, Australia)

6) H. Oota, N. Saitou, T. Matsushita, S. Ueda
Title: Molecular genetic analyses of 2,000-year old humans from Chinese
Mainland and its relevance for population history in Japanese archipelago. (Talk)
European Research Conferences, Inherited Disorders and Their Genes in Different European Populations (May.6-10.1999 Obernai, France)

7) H. Oota, T. Kitano, F. Jin, I. Yuasa, L. Wang, S. Ueda, N. Saitou, M. Stoneking
Title: Homogeneity of mitochondrial DNA variation in Asians (Talk)
Human Origin and Disease (Oct.25.2000 Cold Spring Harbor Laboratory, U.S.A.)

8) H. Oota, A. J. Pakstis, J. R. Kidd, K. K. Kidd
Title: Aldehyde dehydrogenase 2 (ALDH2): Strong LD around the world (Poster)
The American Society of Human Genetics, 52nd Annual Meeting (Oct.17.2002 Baltimore, U.S.A.)

9) H. Oota, A. J. Pakstis, J. R. Kidd, K. K. Kidd
Title: Worldwide survey reveals a reduced number of haplotypes and strong LD at the ALDH2 locus (Poster)
CSHL Meeting: Human Origin and Disease (Oct.21.2002 Cold Spring Harbor Laboratory, U.S.A.)

10) H. Oota, W. C. Speed, J. R. Kidd, K. K. Kidd
Title: Evolution of the Alcohol Dehydrogenase Class I Gene Cluster in Human and Non-human Primates (Poster)
The American Society of Human Genetics, 53rd Annual Meeting (Dec.6.2003 Los Angeles, U.S.A.)

11) H. Oota, W. C. Speed, J. R. Kidd, K. K. Kidd
Title: An Evolutionary Study on the ADH Gene Cluster in Human and Non-Human Primates (Talk)
2004 New England Biological Anthropology Symposium (Feb. 20. 2004 New Haven, U.S.A.)

12) H. Oota, R. Kaul, C. Dunn, W.C. Speed, A.J. Pakstis, J. R. Kidd, M. Olson, K. K. Kidd
Title: A comparative study on the alcohol dehydrogenase (ADH) gene cluster in primate lineage. (Talk)
International Conference on Primate Genome (Mar. 21, 2005 Seattle, U.S.A.)

13) H. Oota, A.J. Pakstis, W.C. Speed, J. R. Kidd, K. K. Kidd
Title: A curious pattern of variation at the ALDH2 locus. (Poster)
The American Society of Human Genetics, 55th Annual Meeting (Oct. 26, 2005 Salt Lake City, U.S.A.)

14) H. Oota, R. Kaul, K.Hui, W.C. Speed, J.R. Kidd, M. Olson, K.K. Kidd
Title: New evidence on the molecular evolution of the ADH gene cluster in primates. (Poster)
The American Society of Human Genetics, 56th Annual Meeting (Oct. 11, 2006 New Orleans, U.S.A.)

15) H. Oota, A.J. Pakstis, M.-Y. Lee, J.R. Kidd, K.K. Kidd
Title: Distinctive LD and haplotype frequencies in human populations extend beyond ALDH2. (Poster)
The American Society of Human Genetics, 57th Annual Meeting (Oct. 25, 2007 San Diego, U.S.A.)

16) H. Oota, Y. Matsumoto, Y. Asaoka, H. Nishina, K. Watanabe, J. M. Bujnicki1, S. Oda, S. Kawamura, H. Mitani
Title: Are genes that are highly diversified between human populations also variable in the medaka populations? (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jun. 5 -8, 2008 Barcelona, Spain)

17) T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: A study of functional differences between alleles in P450 genes for medaka fish (Oryzias latipes) (Poster)
Genetics 2010: model organisms to human biology (Jun. 12 - 15, 2010 Boston, U.S.A.)

18) S. Nakagome, S. Mano, J.R. Kidd, K.K. Kidd, S. Kawamura, H. Oota
Title: An evolutionary analysis of the NOD2 gene associated with Crohn’s disease (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 4 -8, 2010 Lyon, France)

19) S. Kawamura, T. Hiwatashi, Y. Okabe, T. Tsutsui, C. Hiramatsu, A.D. Melin, H. Oota, C. M. Schaffner, F. Aureli, L.M. Fedigan, H. Innan
Title: A population genetic test of balancing selection for color vision variation in New World monkeys. The 23rd International Primatological Society Congress Kyoto 2010: Symposium "Variation and Evolution of Primate Color Vision Revealed by Cross-disciplinary Studies" (Oral)
Symposium organized by S. Kawamura and A. D. Melin (September 12-18, 2010 Kyoto, Japan,

20) Y. Matsushita, H. Oota, B. Welker, S. Kawamura
Title: Toward deeper understanding color vision of howler monkeys (Poster)
International Primatological Society XXIII Congress Kyoto 2010 (Sep. 12 - 18, 2010 Kyoto, Japan)

21) Y. Matsushita, H. Oota, B. Welker, M. Pavelka, S. Kawamura
Title: Molecular genetic reevaluation of the uniform-trichromacy hypothesis for howler monkeys (Poster)
The 4th International Symposium of the Biodiversity and Evolution, Kyoto University Global COE project "Evolution of Sensor, Communication and Society" (Sep. 11-12, 2010 Kyoto, Japan)

22) T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: Allelic Variations of Cytochrome P450 Genes in Wild Medaka Populations: a Parallelism to Human Alleles (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 26 - 30, 2011 Kyoto, Japan)

23) S. Nakagome, S. Mano, L. Kozlowski, J.M. Bujnicki, H.Shibata, Y. Fukumaki, J.R. Kidd, K.K. Kidd, S. Kawamura, H. Oota
Title: Population specific distribution of Crohn’s disease risk alleles on the NOD2 locus and natural selection on standing variation (Oral)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 26 - 30, 2011 Kyoto, Japan)

24) A. Sato, F. Campos, H.Oota, K. Jack, A. Di Fiore, F. Aureli, L. Fedigan, S.Kawamura
Title: Genetic Variation in Wild Capuchins and Spider Monkeys in Costa Rica: Implications for Dispersal Patterns (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 26 - 30, 2011 Kyoto, Japan)

25) K. Sakurai, M. Bergstrom, M. Shirasu, H. Imai, K. Touhara, H. Oota, F. Aureli, L. Fedigan, S. Kawamura
Title: Toward Understanding Importance of Chemical Sense in Primates: a Study of Natural Populations of Color-Vision Polymorphic New World Monkeys (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 26 - 30, 2011 Kyoto, Japan)

26) N. Ishizaki, Y. Shirai, Y. Fukuyo, H. Ishida, K.K. Kidd, H. Oota, S. Kawamura
Title: Toward Understanding Evolutionary Force behind Color Vision Polymorphism in Humans (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 26 - 30, 2011 Kyoto, Japan)

27) Y. Matsushita, H. Oota, B. Welker, M. Pavelka, S. Kawamura
Title: Finding a Polymorphism of the L-M Opsin Gene in Howler Monkeys Which Have Been Supposed to Have Uniform Trichromacy in New World Monkeys (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jul. 26 - 30, 2011 Kyoto, Japan)

28) T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: Allelic Variations of Cytochrome P450 Genes in Wild Medaka Populations: Curious Similarities to Humans’ Polymorphisms and Their Functions (Oral)
Isogenic Medaka Workshop (Sep. 26 - 27, 2011, EBI, Hinxton, UK)

29) S. Nakagome, S. Mano, L.Kozlowski, J.M. Bujnicki, H. Shibata, Y. Fukumaki, J.R. Kidd, K.K. Kidd, S. Kawamura, H Oota.
Title: Population specific susceptibility to Crohn’s disease and signals of natural selection on standing variation. (Poster)
The 12th ICHG/The 61th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics (Oct.11 - 15, 2011, Montreal, Canada)

30) T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: Allelic Variations of Cytochrome P450 1B1 in Wild Medaka Populations: Curious Similarities to Humans’ Polymorphisms and Their Functions (Poster)
The 1st Strategic Meeting for Medaka Research (Nov. 23-24, 2011, Okazaki, Japan)

31) T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: Medaka (Oryzias latipes) as a population model for studying functional differences between the alleles of human polymorphisms (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jun. 23 - 26, 2012 Dublin, Ireland)

32) Y. Matsushita, H. Oota, B. Welker, M. Pavelka, S. Kawamura
Title: Color vision variation of trichromacy by L/M hybrid genes in wild populations of New World howler monkeys (Poster)
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting (Jun. 23 - 26, 2012 Dublin, Ireland)

33) Y. Matsushita, H. Oota, B. Welker, M. Pavelka, S. Kawamura
Title: Possible anomalous trichromacy of color vision by hybrid L/M opsin genes in wild howler monkeys, Alouatta
International Primatological Society XXIV Congress (Aug. 12 - 17, 2012, Cabcun, Mexico)

34) S. Kawamura, K. Sakurai, M. Bergstrom, M. Shirasu, Y. Matsushita, A. Melin, H. Imai, K. Touhara, H. Oota, F. Aureli, L. Fedigan
Title: Assessment of bitter taste receptor gene variation and dietary fruit odorants in natural populations of color-vision polymorphic New World Monkeys
International Primatological Society XXIV Congress (Aug. 12 - 17, 2012, Cabcun, Mexico)
      
35) T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: Naturally occurring variation of CYP xenobiotic enzyme alleles inmedaka sheds a new light on sexual dimorphism variation among human populations
               
36) T. Nishimaki, Y. Kimori, T. Katsumura, S. Oda, T. Hanihara, H. Oota
Title: Reconstructing 3D image based on tissue sections of internally fertilized egg in Oryzias latipes (Poster)
19th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting(Sep.20-21,2013,Sendai,Japan)

37) K. Naruse, Y. Taniguchi, S. Kuninaka, S. Oda, M. Shinya, A. Oga, H. Oota, Y. Kamei
Title: Collaborative efforts for the establishment of human disease model using Medaka Presentation (Poster)
1st Zebrafish for Personalized/Precision Medicine Conference (Oct.16-18, 2013, Toronto, Canada)

38) S. Nakagome, H. Chinen, H. Said, W. Suda, A. Iraha, A. Hokama, F. Kinjo, J. Fujita,Y. Takeyama, S. Sakisaka, T. Matsui, J. R. Kidd, K. K. Kidd, S. Kawamura, T.Hanihara, R. Kimura, H. Ishida, H. Morita, M. Hattori, S. Mano, H. Oota
Title: Evolutionary insights into genetic and environmental factors for Crohn’s disease in Ryuku and Northern Kyushu (Poster)
American Society of Human Genetics 2013 Annual Meeting (Oct.22-26, 2013,
Boston)

39) T. Akiyama, T. Katsumura, S. Nakagome, K. Joh, H. Soejima, K. Fujimoto, R. Kimura, H. Ishida, T. Hanihara, S. Higuchi, H. Oota
Title: Association between the PERIOD2 gene polymorphism and the physiological polytypism for light sensitivity in humans (Poster)
Sokendai International Symposium “Modern Human Diversity on Genes and Culture: with special reference to Asia and Oceania” (Feb.3-4 ,2014,Hayama, Japan)

40) T. Akiyama, S. Higuchi, H. Oota
Title: A genetic polymorphism of the PER2 gene associates with physiological
polytypisms for light sensitivity in humans
The International union of anthropological and ethnological sciences Inter-
Congress (May 15-18,2014,Chiba,Japan)


招待講演ではない国内学会での発表

2002年以前は全て省略。年代の古い順)

1太田博樹A. J. PakstisJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: アルデヒド分解酵素(ALDH2)遺伝子座位の分子進化および集団遺伝学的解析
日本遺伝学会 第75回大会(仙台)2003926日(口頭)

2太田博樹A. J. PakstisJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: アルデヒド分解酵素(ALDH2)遺伝子座位の遺伝的多様性と連鎖不平衡:その人類学的考察
日本人類学会 第57回大会(伊達)2003104日(口頭)

3太田博樹W. C. SpeedJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: ヒトおよびヒト以外の霊長類におけるアルコール分解酵素クラスI遺伝子クラスターの分子進化
日本分子生物学会 第26回大会(神戸)20031212日(ポスター)

4太田博樹W. C. SpeedJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: Evolution of the alcohol dehydrogenase (ADH) Class I gene cluster: Duplicated genes “escaped” from homogenization via gene conversion in primate lineage (?)
日本進化学会 第6回大会(東京)200486日(口頭)

5太田博樹C. W. DunnW. C. SpeedJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: 遺伝子の重複と変換:霊長類におけるアルコール分解酵素(ADH)遺伝子クラスターの分子進 / Gene Duplication and Conversion: Evolution of the Alcohol Dehydrogenase Gene (ADH) Cluster in Primates.
日本分子生物学会 第27回大会(神戸)2004129日(ポスター)

6太田博樹C. W. DunnW. C. SpeedA. J. PakstisJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: 霊長類 ClassI ADH 遺伝子クラスターの進化
日本遺伝学会 第75回大会(東京)2005926日(口頭)

7太田博樹B. PakendorfG. WeissA. von HaeselerS. PookajornW. Settheetham-IshidaD. TiwawechT. IshidaM. Stoneking
Title: 狩猟採集民ムラブリの文化的先祖帰り
日本人類学会 第59回大会(横浜)2005114日(口頭)

8S-P. Chen太田博樹Y-M.ShiaoM. StonekingS. Wu
Title: 台湾原住民のmtDNA多様性
日本人類学会 第60回大会(高知)2006114日(口頭)

9)松本圭史、太田博樹、渡辺幸治、尾田正二、河村正二、三谷啓志
Title: ヒトで顕著な集団間分化が示された遺伝子座におけるメダカ集団での地域差
特別領域研究「ゲノム」4領域2007年度合同班会議(神戸)2007625-26日(ポスター)分担者・三谷啓志の研究協力者として発表

10太田博樹、松本圭史、渡辺幸治、尾田正二、河村正二、三谷啓志
Title: Fst値非同義置換をもつヒトの遺伝子はメダカ近縁種内でも多様か?
日本進化学会 第9回大会 (京都) 2007831日(口頭)

11松本圭史、太田博樹、仁科博史、浅岡洋一、渡辺幸治、尾田正二、河村正二、三谷啓志
Title: ヒト集団で高度な分化を示す非同義置換SNPを含む遺伝子はメダカでも高い地域差を示すか?
東京大学生命研究ネットワークシンポジウム2007(東京)2007915日(ポスター)

12中込滋樹、竹山康章、向坂彰太郎、松井敏幸、河村正二、太田博樹
Title: クローン病原因候補遺伝子の集団遺伝学解析
東京大学生命研究ネットワークシンポジウム2007(東京)2007915日(ポスター)

13松本圭史、太田博樹、仁科博史、浅岡洋一、渡辺幸治、尾田正二、河村正二、三谷啓志
Title: ヒト集団間で地理的に高度な分化を示す遺伝子はメダカでも高い地域差を示すか?
13回小型魚類研究会(東京) 2007917日(口頭)

14松草博隆、太田博樹、河村正二、羽地都映、当真隆、石田肇
Title: mtDNAY-STRから見た琉球諸島(宮古・石垣島)住民の遺伝的多様性
日本人類学会 第61回大会(新潟)2007104日(口頭)

15白井祐介、太田博樹、河村正二
Title:ヒト色覚変異の適応的意義検討に向けたL-Mオプシン遺伝子解析法の開発
日本人類学会 第61回大会(新潟)2007104日(口頭)

16太田博樹、松本圭史、仁科博史、浅岡洋一、渡辺幸治、尾田正二、河村正二、三谷啓志
Title: ヒトメダカ集団ゲノム解析にもとづく環境適応と関連する多型遺伝子のスクリーニング
日本分子生物学会(第30回)日本生化学会(第80回)合同大会(横浜)20071211日(ポスター)

17覚張隆史、太田博樹、大谷進、米田穣
Title: 硬部組織遺留物におけるアミノ酸のラセミ化率とDNA残存量の相関に関する検討
日本法医学会 第92次総会(長崎)2008424日(ポスター)

18勝村啓史、尾田正二、勝呂尚之、渡辺幸治、三谷啓志、太田博樹、河村正二
Title: メダカ:集団比較ゲノム解析モデル脊椎動物としての有用性の検証
特別領域研究「ゲノム」4領域2008年度合同班会議(神戸)2008825-27日(ポスター)分担者・三谷啓志の研究協力者として発表

19勝村啓史、尾田正二、勝呂尚之、渡辺幸治、三谷啓志、太田博樹、河村正二
Title: 野生メダカにおける集団内多様性の集団遺伝学的解析
日本遺伝学会 80回大会(名古屋)200895日(口頭)

20勝村啓史、尾田正二、勝呂尚之、渡辺幸治、三谷啓志、太田博樹、河村正二
Title: メダカ:ヒト多型機能解明に向けた集団比較ゲノム解析モデル脊椎動物としての有用性の検証
14回小型魚類研究会(岡崎)2008921日(口頭)

21中込滋樹、竹山康章、向坂彰太郎、松井敏幸、間野修平、河村正二、太田博樹
Title: クローン病原因候補アレルの北部九州日本人における頻度
日本人類遺伝学会 第53回大会(横浜)2008929日(ポスター)

22樋渡智秀、白井祐介、三上章允、後藤俊二、Suryobroto BAMBANGPerwitasari-Farajallah DYAHMalaivijitnond SUCHINDASiriaroonrat BORIPAT太田博樹、河村正二
Title: テナガザルL-Mオプシン遺伝子の属を越えた非多型性
日本霊長類学会 第25回大会(岐阜)2009719日(口頭)

23河村正二、樋渡智秀、岡部友吾、筒井登子、平松千尋、太田博樹、印南秀樹
Title: 新世界ザル自然集団の色覚多型に対する平衡選択の明瞭な証拠
日本霊長類学会 第25回大会(岐阜)2009719日(口頭)

24福世裕貴子、足立和隆、河村正二、太田博樹
Title: 原猿および真猿類における時計遺伝子Period1上流領域の塩基配列比較解析
日本霊長類学会 第25回大会(岐阜)2009720日(口頭)

25佐藤亮子、太田博樹Katharine JACKLinda FEDIGAN、河村正二
Title: コスタリカ・サンタロサ国立公園に生息するシロナガオマキザル自然群間の遺伝的関係の解明に向けて
日本霊長類学会 第25回大会(岐阜)2009720日(口頭)

26勝村啓史、尾田正二、三谷啓志、河村正二、太田博樹
Title: メダカ集団を用いたヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の構築
特別領域研究「ゲノム」4領域2009年度合同班会議(神戸)2009831-91日(ポスター)分担者・三谷啓志の研究協力者として発表

27勝村啓史、尾田正二、三谷啓志、河村正二、太田博樹
Title: メダカ集団を用いたヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の開発
日本進化学会 第11回大会(札幌)200993-4日(ポスター)

28佐藤亮子、Fernando CAMPOS太田博樹Katharine JACKLinda FEDIGAN、河村正二
Title: コスタリカ・サンタロサ国立公園に生息する野生オマキザル群の遺伝的多様性の解明に向けて
日本遺伝学会 第81回大会(長野)2009917日(口頭)

29小金渕佳江、松草博隆、中込滋樹、石田肇、埴原恒彦、副島英伸、藤本一眞、河村正二、太田博樹
Title: ADH1BおよびALDH2における琉球諸島vs北部九州ヒト集団の比較遺伝学
解析
日本人類遺伝学会 第54回大会(東京)2009925日(ポスター)

30木村亮介、山口徹太郎、槙宏太郎、武田摩耶子、近藤修、埴原恒彦、大沢資樹、石田肇、河村正二、太田博樹
Title: 歯形態の遺伝学:シャベル型切歯とEDAR
日本人類学会 第63回大会(東京)2009103日(口頭)

31中込滋樹、竹山康章、間野修平、向坂彰太郎、松井敏幸、河村正二、太田博樹
Title: 日本人とヨーロッパ人におけるクローン病原因候補遺伝子の違い
日本人類学会 第63回大会(東京)2009103日(口頭)

32小金渕佳江、松草博隆、中込滋樹、石田肇、埴原恒彦、副島英伸、藤本一眞、河村正二、太田博樹
Title: ADH1BおよびALDH2における琉球諸島vs北部九州ヒト集団の比較遺伝学解析
日本人類学会 第63回大会(東京)2009103日(口頭)

33覚張隆史、太田博樹、大谷進、米田穣
Title: Relationship between DNA Quantity and Amino Acid Racemization Rate in Ancient Biological Remains
日本分子生物学会 第32回大会(横浜)20091211日(ポスター)

34中込滋樹、間野修平、竹山康章、向坂彰太郎、松井敏幸Judith R. KiddKenneth K. Kidd、河村正二、太田博樹
Title: Linkage disequilibrium analysis and specific polymorphisms to local human populations across Crohn’s disease genomic regions
日本分子生物学会 第32回大会(横浜)20091211日(ポスター)

35勝村啓史, 尾田正二, 三谷啓志, 河村正二, 太田博樹
Title: Analysis of human polymorphisms in cytochrome P450 gene family using medaka (Oryzias latipes) local-wild populations
日本分子生物学会 第32回大会(横浜)20091211日(ポスター)

36小金渕佳江、松草博隆、中込滋樹、石田肇、埴原恒彦、副島英伸、藤本一眞、河村正二、太田博樹
Title: Linkage disequilibrium analysis of alcohol-metabolizing gene cluster and East Asian specific haplotypes
日本分子生物学会 第32回大会(横浜)20091211日(ポスター)

37福世裕貴子、勝村啓史、足立和隆、河村正二、太田博樹
Title: A comparative genome analysis of the Period 1 gene upstream region in primates
日本分子生物学会 第32回大会(横浜)20091211日(ポスター)

38太田博樹R. KaulM. Olson、柴田弘紀、河村正二、W.C. SpeedJ. R. KiddK. K. Kidd
Title: A comparative genome analysis of the alcohol dehydrogenase gene cluster in primates
日本分子生物学会 第32回大会(横浜)20091211日(ポスター)

39勝村啓史、尾田正二、三谷宏志、河村正二、太田博樹
Title: 野生メダカ集団におけるcytochrome P450遺伝子のアレル間機能差
日本進化学会 第12回大会(東京)201083日(口頭)

40勝村啓史、尾田正二、三谷宏志、河村正二、太田博樹
Title: ヒト遺伝的多型の機能解析実験モテル生物としての野生メタカ集団の有用性 cytochrome P450 遺伝子に着目して
小型魚類研究会 第16回大会(埼玉)2010919日(口頭)

41勝村啓史、尾田正二、三谷宏志、河村正二、太田博樹
Title: 水田の拡散とメダカの移動
日本人類学会 第64回大会(伊達)2010103日(口頭)

42勝村啓史、尾田正二、三谷宏志、河村正二、太田博樹
Title: ヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の構築メダカを用いた新たなアプローチ
4回総研大ワークショップ(相模原) 20101023-24日(口頭+ポスター)

43勝村啓史、尾田正二、三谷啓志、河村正二、太田博樹
Title: ヒトCYP多型とメダカ地域集団を用いた生体機能解析
1CYP研究会(葉山) 20101117日(口頭)

43松下裕香、太田博樹Barbara WELKER、河村正二
Title: 新世界ザルホエザル属におけるヒト型3色型色覚仮説の検証
日本人類学会 第64回大会(伊達)2010102日(口頭)

44勝村啓史、尾田正二、三谷宏志、河村正二、太田博樹
Title: メダカ地域集団間のCYP 酵素活性の違い
33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会、神戸ポートアイランド、神戸、2010127-10日.(ポスター)

45勝村啓史、尾田正二、三谷宏志、河村正二、太田博樹
Title: メダカ集団を用いたヒト多型の生体機能解析実験系の検討-cytochrome P450に着目して
11 東京大学生命科学シンポジウム、東京大学本郷キャンパス、東京、201164日.(ポスター)

46松下裕香、太田博樹Barbara WELKERMary PAVELKA、河村正二
Title: 新世界霊長類の中で唯一恒常的3色型色覚とされるホエザル属における種内L-Mオプシン多型の発見
11 東京大学生命科学シンポジウム、東京大学本郷キャンパス、東京、201164日.(ポスター)

47櫻井児太摩、今井啓雄、東原和成、太田博樹Aureli, F.Fedigan, L.、河村正二
Title: 色覚種内多型を示す新世界ザル野生集団における化学物質感覚センサーの多型解析 (経過報告)
日本霊長類学会 第27回大会(犬山)2011710日(口頭)

48松下裕香、太田博樹Barbara WELKERMary PAVELKA、河村正二
Title: 恒常的3色型色覚とされてきたホエザル属における種内L-Mオプシン多型の発見
日本霊長類学会 第27回大会(犬山)2011710日(口頭)

49櫻井児太摩、Bergstrom, M.、白須未香、今井啓雄、東原和成、太田博樹Aureli, F.Fedigan, L.、河村正二
Title: Toward understanding importance of chemical sense in primates: a study of natural populations of color-vision polymorphic New World monkeys.
13回日本進化学会、京都大学百周年時計台記念館、京都、2011729-31 (ポスター)

50石崎直也、白井裕介、福世裕貴子、石田肇、Kidd, K. K.太田博樹、河村正二
Title: Toward understanding evolutionary force behind color vision polymorphism in humans.
13回日本進化学会、京都大学百周年時計台記念館、京都、2011729-31 (ポスター)

51勝村啓史、尾田正二、三谷啓志、河村正二、太田博樹
Title: Allelic variations of cytochrome P450 genes in wild medaka populations: a parallelism to human alleles.
13回日本進化学会、京都大学百周年時計台記念館、京都、2011729-31 (ポスター) 優秀ポスター賞

52松下裕香、太田博樹Welker, B.Pavelka, M.、河村正二
Title: Finding a polymorphism of the L-M opsin gene in howler monkeys which have been supposed to have uniform trichromacy in New World monkeys.
13回日本進化学会、京都大学百周年時計台記念館、京都、2011729-31 (ポスター)

53松下裕香、太田博樹Welker, B.Pavelka, M.、河村正二
Title: 新世界ホエザル野生群に対する旧世界霊長類型3色型色覚の多型性調査
83回日本遺伝学会、京都大学吉田キャンパス北部構内、京都、2011920-23日.(口頭)

54太田博樹
Title: 人類の形態、生理・代謝、疾患の進化に関するゲノム多様性研究
統数研研究集会、統計数理学研究所、立川、20111219-20日.(口頭)

55西槇俊之、勝村啓史、尾田正二、古賀厚徳、埴原恒彦、太田博樹
Title: ニホンメダカ(Oryzias latipes)全身組織切片に観察
された変異2例の報告
23回生物学技術研究会、岡崎、基礎生物学研究所、2012216-17日.(口頭)

56尾田正二、浅香智美、保田隆子、三谷啓志、藤原智子、藤堂剛、西槙俊之、勝村啓史,太田博樹、埴原恒彦、小賀厚徳、佐々木功典、谷口義仁、木森義隆、亀井保博
Title: メダカ全身連続組織切片のバーチャルスライド化による組織切片画像のインターネットシェアリングとMathematical Morphologyによる定量的組織学を中心とした宇宙メダカサンプルのリソース化・解析のための基盤技術開発
26回日本宇宙生物科学会学術集会、徳島大学、2012511日.(口頭)

57米田穣、太田博樹、日下宗一郎、覚張隆史、小山荘太郎
Title: 保美貝塚出土人骨・獣骨の分析
日本考古学協会、第78回総会研究発表プログラム、大正大学大崎キャンパス、東京、2012527日.(口頭)

58河村正二、櫻井児太摩、白須未香、松下裕香、Amanda MELINMackenzie BERGSTROM、今井啓雄、東原和成、太田博樹Filippo AURELILinda FEDIGAN
Title: 新世界ザル野生集団における苦味受容体遺伝子群の多様性と採食果実の香気成分分析
28回日本霊長類学会、椙山女学園大学、名古屋、201276-8日.(口頭)

59小林裕太、野城真理、大林康二、崔東学、太田博樹、西槇俊之、小久保謙一,小林弘祐
Title: メダカの超高速OCT画像からの心臓領域セグメンテーション
25回北里大学バイオサイエンスフォーラム研究会、201285-6日.(口頭)

60尾田正二、太田博樹、西槙俊之、勝村啓史、小賀厚徳、佐々木功典、谷口義仁、木森義隆、亀井保博
Title: メダカの全身組織ブラウジングシステム〜理科教育におけるメダカ活用のための新ツール
日本理科教育学会、第62回大会 鹿児島大学郡元キャンパス、2012811-12日.(口頭)

61河村正二、櫻井児太摩、白須未香、松下裕香、Amanda MELINMackenzie BERGSTROM、今井啓雄、東原和成、太田博樹Filippo AURELILinda FEDIGAN
Title: 新世界ザル野生集団における苦味受容体遺伝子群の種内変異と採食果実の香気成分分析
14回日本進化学会、首都大学東京南大沢キャンパス、2012821-24日.(口頭)

62N. Suzuki, T. Yasuda, T. Nishimaki, T. Katsumura, H. Oota, T. Hanihara, A. Oga, H. Mitani, K. Yamamoto, ○S. Oda
Title: Immunohistochemistry with anti-sugar monoclonal antibody and lectin staining of whole body histological sections in medaka.
小型魚類研究会 第18回大会(京都)2012922-23日(ポスター)

63○T. Nishimaki, T. Katsumura, S. Oda, A. Oga, T. Hanihara, H. Oota
Title: A preliminary study of histo-pathological variations in Medaka (Oryzias latipes) using whole-body serial tissue sections
小型魚類研究会 第18回大会(京都)2012922-23日(ポスター)

64○T. Katsumura, S. Oda, H. Mitani, S. Kawamura, H. Oota
Title: A population genetic study and phylogenetic reconstruction of medaka migration across the Japanese archipelago based on nucleotide sequences of the mitochondrial genome D-loop region
小型魚類研究会 第18回大会(京都)2012922-23日(ポスター)

65) 佐藤丈寛、川口亮、石田肇、山口徹太郎、山本健、河村正二、中込滋樹、間野修平、埴原恒彦、太田博樹、渡辺千晶、山口今日子、木村亮介
         
Title:ゲノムワイドSPNデータに基づく琉球列島の人々の集団構造
66回日本人類学会大会(神奈川)2012112-4 (口頭)

66) 中込滋樹、知念寛、竹山康章、Said H. S.、須田亙、木村亮介、石田肇、埴原恒彦、Kidd J. R.Kidd K. K.、河村正二、森田英利、服部正平、間野修平、太田博樹
Title:琉球諸島と北部九州におけるクローン病の遺伝と環境の相互作用に関する人類学的考察
66回日本人類学会大会(神奈川)2012112-4日(口頭)

67) 西村貴孝、本井碧、星良和、近藤隆一郎、太田博樹、綿貫茂喜
Title:現代日本人の寒冷適応能とミトコンドリアハプログループの関係について
66回日本人類学会大会(神奈川)2012112-4日(口頭)

68) 勝村啓史、尾田正二、三谷啓志、埴原恒彦、河村正二、太田博樹
Title: ヒトとメダカ共通に観察された地域集団間の性的二型の程度の違いに関与する遺伝的多型
66回日本人類学会大会(神奈川)2012112-4日(口頭)

69) 覚張隆史(東大・総合研究博物館)、太田博樹(北里大・医)、大谷進(山梨大・医)、米田穣(東大・総合研究博物館)
Title: 動物遺存体および化石における古代DNA分析の新たなプレスクリーニング法
66回日本人類学会大会(神奈川)2012112-4日(口頭)

70) 西槇俊之、勝村啓史、尾田正二、古賀厚徳、埴原恒彦、太田博樹
Title: 小型魚類を使った全身切片メダカから金魚へー
24回生物学技術研究会、岡崎、基礎生物学研究所、2013221-22日.(口頭) (ポスター)

71) 小金渕佳江、松草博隆、中込滋樹、石田肇、埴原恒彦、城圭一郎、副島英伸、藤本
一眞、河村正二、太田博樹、アジア人DNAレポジトリーコンソーシアム
Title: アルコール代謝関連遺伝子群を用いた日本列島ヒト集団の遺伝的多様性の検証
26回北里大学バイオサイエンスフォーラム、北里大学相模原キャンパス、201388-9.(口頭)

72)秋山辰穂、勝村敬史、樋口重和、安河内朗、藤本一真、副島英伸、城圭一郎、中込滋樹、石田肇、埴原恒彦、太田博樹
Title: 光刺激応答の生理的多様性に関与する時計遺伝子多型の同定
26回北里大学バイオサイエンスフォーラム(相模原)201388-9日(口頭)

73) 栗山友理子、石崎直也、白井裕介、福世裕貴子、Kenneth K. Kidd太田博樹、手島康介、河村正二
Title: ヒト色覚多型の起源解明を目指したL-Mオプシン遺伝子間塩基相違度のExon*intron領域による違い方の集団間及び種間比較
67回日本人類学会大会(茨城)2013111-4日(口頭)

74) 秋山辰穂、勝村敬史、埴原恒彦、太田博樹、中込滋樹、藤本一真、副島英伸、城圭一郎、木村亮介、石田肇、安河内朗、樋口重和
Title: 時計遺伝子PERIOD2の多型と光刺激応答の生理的多様性の関係及びその人類学的考察
67回日本人類学会大会(茨城)2013111-4日(口頭)

75) 小金渕佳江、中込滋樹、間野修平、石崎直也、河村正二、木村亮介、石田肇、城圭一郎、副島英伸、藤本一真、佐藤公俊、安井美江、隈部俊宏、藤井清隆、秋山辰穂、埴原恒彦、太田博樹
Title: モヤモヤ病原因遺伝子RNF213の琉球諸島・北部九州ヒト集団における遺伝的多型
67回日本人類学会大会(茨城)2013111-4日(口頭)

76) 松前ひろみ、間野修平、太田博樹
Title: 人類学の立場からパーソナルゲノムプロジェクトを考える
36回日本分子生物学会年会(兵庫)2013123-6日(口頭)

77) 尾田正二、浅香智美、保田隆子、三谷啓志、谷口善仁、太田博樹、勝村敬史、
西槙俊之、埴原恒彦、小賀厚徳、木森義隆
Title: 動きと組織切片像の数値化によるメダカの全部の定量化
メダカを使った解析パイプライン~ヒト疾患モデルとしてのメダカ:コンディショナルKOなどを使った多面的解析系の確立~(愛知)201438日(口頭)

78) 西槙俊之、木森義隆、勝村啓史、尾田正二、埴原恒彦、太田博樹
Title: メダカ体内受精卵の全身組織切片からの組織学的解析ー受精卵の三次元再構築を中心にー  
119回日本解剖学会全国学術集会(栃木)2014327-29日(ポスター)

79)秋山辰穂、勝村啓史、中込滋樹、城圭一郎、副島英伸、藤本一真、木村亮介、石田肇、埴原恒彦、樋口重和、太田博樹
Title: メラトニン抑制に関する生理的多型と時計遺伝子PERIOD2多型との関係及びその適応的意義の考察
70回日本生理人類学会大会(福岡)201462122日(口頭)

80) 松前ひろみ、仲里猛留、大田達郎、太田博樹
Title: 化石標本とライフサイエンスデータを統合する進化史研究の基盤データベースの開発
日本進化学会第16回大阪大会(大阪)2014821-24日(ポスター)

81) 勝村啓史、尾田正二、三谷啓志、河村正二、太田博樹
Title: 薬物代謝酵素の遺伝的多型がメダカの性的二型に与える影響とその進化学的考察

日本進化学会第16回大阪大会(大阪)2014821-24日(ポスター)